اتاق تمیز یا clean room محلی است که در آن آلاینده‌ها، ذرات گرد و غبار، میکروب‌ها، رطوبت و … را به دلیل برخی پژوهش‌های علمی و تولید به حداقل رسانیده‌اند. در این اتاق‌ها با استفاده از ابزارهایی که بعدا به آن‌ها اشاره خواهد شد، این موارد را تحت کنترل درآورده و محیط را برای انجام تحقیقات آماده‌سازی می‌کنند.